背景[]
10月9日，由于阿维尼翁的进攻作战，学园都市治安变得薄弱。成为无法地带的此地，黑暗组织在暗中活跃。生活在学园都市黑暗中的组织伺机而动，各自为自己的目的行动着。
暗部是维持学园都市内部的安定和执行“无法向光明表达的事”的组织，干的活有暗杀、镇压、销毁资料等等。暗部分为隶属理事会的、直属于理事长的和无上级自己行动的。暗部组织对于明面上的人来说是保密的，不能轻易知晓，即使是入侵“书库”也只是知道组织名字而已。
事件涉及暗部组织：
Group（隶属于统括理事会）：一方通行、土御门元春、结标淡希、伪海源光贵（艾札力）；
Item（隶属于统括理事会）：麦野沉利（首领）、绢旗最爱、泷壶理后、芙兰达 塞维伦、滨面仕上（打杂的）；
Block（隶属于统括理事会）：佐久未彦（首领）、手盐惠未、山手、铁网；
School（隶属于统括理事会）：垣根帝督（首领）、“礼服女”（本名不明）、誉望万化、弓箭猎虎（前狙击手）、砂皿致密（现雇佣狙击手）；
Member（直属于统括理事长）：“博士”（首领、本名不明）、马场芳郎、查乐、席琪桃尔、警策看取；
剧情介绍[]
土御门元春来到一家百货公司的清扫室会见“人才派遣”，直言自己是来抓他的。土御门先打穿了吧台上稀释剂（易燃）罐子，然后一把火逼出了“人才派遣”并给了他一枪。[1]
同时，从法国阿维尼翁回来的一方通行来到第七学区的医院，最后之作已经出院[2]。在最后之作坐出租车离开后一方才来到“冥土追魂”旁边索要项圈电极的设计图[3]。
押着“人才派遣”的下层组织护送车被戴头环的少年[4]袭击，车子被强行扯断。“人才派遣”被头环少年所杀。
艾札力在“人才派遣”的住处搜查，并往要求下级组织搬的东西上贴上便利贴。在拿着发现的纸钞时遭遇火箭炮袭击。然后“区块”（身穿深灰色装甲服的一群人）闯入房间。
艾札力使用反射金星光的魔法杀死“区块”的一员再剥死者皮用魔法伪装成死者[5]。纸钞被看重是因为学园都市发行的纸币有镶嵌IC芯片，读取芯片可以知道信息。学园都市有自己独立货币局。
一方通行、土御门元春、结标淡希前来公寓找寻艾札力留下的线索。在微波炉里找到艾札力留下的纸币[6]。在衣柜里发现艾札力变装对象。[7]
读取芯片获得一系列信息，同时亲船最中的演讲即将开始，砂皿致密做好狙击准备。
一方让结标送他和土御门去演讲现场，一方破坏了车辆终止演讲致使狙击失败。[8]
垣根帝督让砂皿撤退，纸币读取出雇佣砂皿的人的信息。由此得知还有其他暗部的存在。
“道具”四人在餐厅吃饭。滨面仕上端上饮品。[9]
滨面向“道具”四名正式成员发送情报，随后四人前往基本粒子工学研究所试图阻止“学校”。[10]
在基本粒子工学研究所外，滨面遇见黄泉川爱穗，黄泉川询问滨面车的来历。一辆小轿车驶来，麦野沉利带着泷壶理后追出，麦野要求滨面开车追击。 在追击途中“道具”的车遭到“心理定规”阻截，车被打坏。“心理定规”下车追杀滨面。
“心理定规”追滨面到楼顶，滨面从三楼跳下。
垣根帝督开车来到第四学区的冷冻肉储存仓库。
“集团”得知了新情报，第五学区（计算机）病毒保管中心遭到骇入。根据外部链接终端的紧急中断情况来看是“邀请”他们到那里去。接到人在“区块”的艾札力的电话得知“区块”的目标是第二十三学区的卫星。一方通行决定自己行动于是踹门出去自己找车。
新出场人物[]
- “人才派遣”，是通过关系网补充不足的人才，藉此赚取介绍费的人物。犯罪集团缺乏的人才就是由“人才派遣”补充。
- 誉望万化，暗部“学校”正式成员之一。LV4念动能力者。通过念动力可做到发火、无声化、透明化、电子操作等多样的能力。袭击押送“人才派遣”的运货车并杀害“人才派遣”，在基本粒子工学研究所被麦野沉利杀害。
- 砂皿致密，“学校”雇佣来杀亲船最中的专业狙击手。
- 垣根帝督，学园都市LV5第二位，『未元物质』能力者，视第一位一方通行为眼中钉。
补充说明[]
- ↑ 给“人才派遣”腹部打一枪是要防止他耍花招或者逃跑，土御门还需要他的情报。
- ↑ 最后之作住院是为了清除9月30日由木原数多注入脑中的病毒。
- ↑ 一方通行索要电极图是不想自己的性命受他人操控，但U盘里的内容从基本材料开始全是“冥土追魂”的个人技术。
- ↑ 少年名为誉望万化，是school的正式成员，前来杀人灭口。可惜的是动画里连CV都没有。
- ↑ 灭火及报警装置事先被“区块”的人切断因而没有响应。艾札力手上只有一把黑曜石小刀而公寓外还有不少“区块”的人难以脱逃只能选择伪装。
- ↑ 纸币藏在微波炉里可以遮断电波，即使“区块”的人持有探测器也能躲过。
- ↑ 不救艾札力的原因：“集团”是薄情的组织，基本想法是「自己闯的祸自己解决」，就算有线索也不一定会去救他更何况不知道袭击公寓的是哪路人。
- ↑ 这里有很多信息没表示。一、舞台背后有不锈钢板，演讲地点周围有四台能产生包围整个会场风的特殊车辆，是专门用于妨碍狙击的。二、砂皿在狙击亲船之前事先狙击那四辆车使得干扰失效。三、亲船和护卫们都没有发现狙击妨碍装置已失效，因为磁力狙击炮不用火药几乎无声。四、亲船最中没穿防弹衣。
- ↑ 芙兰达开罐头用的是小型炸药，在罐头贴上一圈胶带般的东西，装上电气引信用炸药炸开。字幕里没翻译出绢旗最爱的口癖“超”。滨面仕上因为先前暗杀御坂美铃计划失败而不得已在“道具”手下打杂。
- ↑ “学校”依旧实行亲船暗杀计划的理由：理事会成员遇袭的话会从其他地方调动警备力量和各种物资来保护VIP，从而使别处警备力量变得薄弱。“学校”的目标就是基本粒子工学研究所里的“镊子”，不管是暗杀谁只要能引起骚乱就行。而亲船最中是警备最薄弱的VIP因而得手机会更高。而“道具”是推测“在警备变得薄弱的设施中学校可能现身的地方”